Das Naturschutzgebiet Miseren - Seeboden erstreckt vom Fluss Steinwasser (ca. 1'850 m ü.M.), welcher entlang der Sustenpasstrasse im Gebiet Berghotel Steingletscher fliesst, über die Moorflächen um den Seebodensee (ca. 2'100 m ü.M.) bis hinauf zum Taleggligrat (ca. 2'400 m ü.M.). Im Areal, welches von Feuchtgebieten wie dem Hochmoor im Gebiet «in Miseren» über dem Steinwasser, vielen Kleinstmooren sowie Arvenbeständen durchsetzt ist, gelten die Regeln für Naturschutzgebiete.